RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AknaQ80VW7 1404 aa37.78■■■■□ 3.64
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm156Q58A37 223 aa37.76■■■■□ 3.64
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CadpsQ80TJ1 1355 aa37.74■■■■□ 3.63
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Abcc1O35379 1528 aa37.72■■■■□ 3.63
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37.68■■■■□ 3.62
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa37.6■■■■□ 3.61
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa37.59■■■■□ 3.61
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PtprtQ99M80 1454 aa37.56■■■■□ 3.6
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Npm2Q80W85 207 aa37.55■■■■□ 3.6
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arhgap27A2AB59 869 aa37.54■■■■□ 3.6
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa37.53■■■■□ 3.6
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Soga1E1U8D0 1418 aa37.53■■■■□ 3.6
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Chd1P40201 1711 aa37.5■■■■□ 3.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Abca16E9PWJ7 1678 aa37.49■■■■□ 3.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Adamts12Q811B3 1600 aa37.48■■■■□ 3.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Abcc2Q8VI47 1543 aa37.47■■■■□ 3.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 WizO88286 1684 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Map3k4O08648 1597 aa37.45■■■■□ 3.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Neo1P97798 1493 aa37.44■■■■□ 3.58
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PxdnQ3UQ28 1475 aa37.43■■■■□ 3.58
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa37.41■■■■□ 3.58
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa37.4■■■■□ 3.58
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm14025A2AP89 1413 aa37.39■■■■□ 3.58
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Carmil1Q6EDY6 1374 aa37.34■■■■□ 3.57
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 BC005561E9Q5E2 1589 aa37.33■■■■□ 3.57
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Map3k1P53349 1493 aa37.28■■■■□ 3.56
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pprc1Q6NZN1 1644 aa37.27■■■■□ 3.56
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slx4Q6P1D7 1565 aa37.21■■■■□ 3.55
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rpap1Q80TE0 1409 aa37.19■■■■□ 3.54
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Setbp1Q9Z180 1582 aa37.19■■■■□ 3.54
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa37.16■■■■□ 3.54
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AI481877A2ALV5 1481 aa37.16■■■■□ 3.54
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arhgap35Q91YM2 1499 aa37.15■■■■□ 3.54
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Jph4Q80WT0 628 aa37.14■■■■□ 3.54
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 HrcG5E8J6 738 aa37.11■■■■□ 3.53
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gab3Q8BSM5 595 aa37.04■■■■□ 3.52
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Abca5Q8K448 1642 aa36.99■■■■□ 3.51
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa36.99■■■■□ 3.51
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Clip1Q922J3 1391 aa36.95■■■■□ 3.51
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ak9G3UYQ4 1894 aa36.95■■■■□ 3.51
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 WrnO09053 1401 aa36.91■■■■□ 3.5
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Igf1rQ60751 1373 aa36.87■■■■□ 3.49
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa36.86■■■■□ 3.49
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cep162Q6ZQ06 1403 aa36.85■■■■□ 3.49
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cux1P53564 1515 aa36.8■■■■□ 3.48
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fyco1Q8VDC1 1437 aa36.79■■■■□ 3.48
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kdm5bQ80Y84 1544 aa36.75■■■■□ 3.47
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Myt1lP97500 1187 aa36.67■■■■□ 3.46
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa36.62■■■■□ 3.45
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arid3cA6PWV5 409 aa36.61■■■■□ 3.45
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ttc37F8VPK0 1563 aa36.59■■■■□ 3.45
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa36.58■■■■□ 3.45
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Wdr7Q920I9 1489 aa36.54■■■■□ 3.44
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AdgbG3UZ78 1657 aa36.54■■■■□ 3.44
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36.51■■■■□ 3.44
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa36.49■■■■□ 3.43
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znf608Q56A10 1511 aa36.46■■■■□ 3.43
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NhsB1AV60 1647 aa36.45■■■■□ 3.43
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zfyve16Q80U44 1528 aa36.44■■■■□ 3.42
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Depdc5P61460 1591 aa36.4■■■■□ 3.42
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ankrd26Q811D2 1581 aa36.39■■■■□ 3.42
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Aebp1Q640N1 1128 aa36.37■■■■□ 3.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atp10dQ8K2X1 1416 aa36.36■■■■□ 3.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cul7Q8VE73 1689 aa36.35■■■■□ 3.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arhgef11Q68FM7 1552 aa36.33■■■■□ 3.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ncoa2Q61026 1462 aa36.33■■■■□ 3.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 BlmO88700 1416 aa36.27■■■■□ 3.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kif27Q7M6Z4 1394 aa36.27■■■■□ 3.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa36.26■■■■□ 3.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa36.24■■■■□ 3.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mroh2aD3Z750 1679 aa36.23■■■■□ 3.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gcc2Q8CHG3 1679 aa36.23■■■■□ 3.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fancd2Q80V62 1450 aa36.23■■■■□ 3.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AglF8VPN4 1532 aa36.21■■■■□ 3.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa36.21■■■■□ 3.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Setd5Q5XJV7 1441 aa36.2■■■■□ 3.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fndc1E9Q043 1732 aa36.18■■■■□ 3.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Abca8bQ8K440 1620 aa36.12■■■■□ 3.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Arap1Q4LDD4 1452 aa36.12■■■■□ 3.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Magi1Q6RHR9 1471 aa36.11■■■■□ 3.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Erich3F6QRE9 1637 aa36.08■■■■□ 3.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Eea1Q8BL66 1411 aa36.07■■■■□ 3.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam163aQ8CAA5 168 aa36.02■■■■□ 3.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 A2mQ6GQT1 1474 aa35.96■■■■□ 3.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Alpk3Q924C5 1678 aa35.94■■■■□ 3.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa35.92■■■■□ 3.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pcf11G3X9Z4 1553 aa35.92■■■■□ 3.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ncoa3O09000 1398 aa35.9■■■■□ 3.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Prex2Q3LAC4 1598 aa35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.1 ms