RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 REG3AQ06141 175 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 DCANP1Q8TF63 244 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 P0DMU3 169 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 FAM231AP0DMU4 169 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 FAM231CP0DMU5 169 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 LINC01006Q8NI28 216 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 PDE6GP18545 87 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 NRACQ8N912 160 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 EP400Q96L91 3159 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB4AO15263 64 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 ESM1Q9NQ30 184 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 C16orf95Q9H693 158 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 APC2O95996 2303 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TIMM17BO60830 172 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TRACP01848 142 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 DAND5Q8N907 189 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 DSCAMO60469 2012 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 TSHBP01222 138 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 FOXI1Q12951 378 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 HCFC1P51610 2035 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 CADP27708 2225 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 COX7BP24311 80 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 PRR9Q5T870 116 aa4.78□□□□□ -1.64
PDE4D-228ENST00000636120 CACNA1BQ00975 2339 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 CEP250Q9BV73 2442 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2AP49459 152 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 LECT2O14960 151 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 hADV29S1A0JD25 119 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZS46 218 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 MUC7Q8TAX7 377 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 CLEC2BQ92478 149 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 CRYGDP07320 174 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.76□□□□□ -1.65
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PDE4D-228ENST00000636120 G3V4G9 280 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 ATOX1O00244 68 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 B9D2Q9BPU9 175 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 TCL1BO95988 128 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 AVPP01185 164 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 PTH2Q96A98 100 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 WFDC2Q14508 124 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 LELP1Q5T871 98 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFB1O75438 58 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 NREPQ16612 68 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 COX17Q14061 63 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2D1P51668 147 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 PROK1P58294 105 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2D3P61077 147 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2D2P62837 147 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 TANC2Q9HCD6 1990 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 V9GYY9 64 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 ROS1P08922 2347 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV1-51P01701 117 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 POLEQ07864 2286 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PPR1 153 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00643Q86TS7 51 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.72□□□□□ -1.65
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