RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635614.1

CD55-211, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), humanhuman

TSL 5

Gene CD55, Length 1,145 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55-211ENST00000635614 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.92□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.92□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.92□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 NIT2Q9NQR4 276 aa6.92□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 Q9UF83 564 aa6.92□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.92□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 M0QY20 66 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 GZMBP10144 247 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 TWIST1Q15672 202 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 OCC1Q8TAD7 63 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 FAM210AQ96ND0 272 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 CNFNQ9BYD5 112 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.91□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.9□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 UBE2L6O14933 153 aa6.9□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 CTRLP40313 264 aa6.9□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 IQCJQ1A5X6 159 aa6.9□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.9□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.9□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.9□□□□□ -1.3
CD55-211ENST00000635614 KRTAP10-1P60331 282 aa6.89□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 COTL1Q14019 142 aa6.89□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.89□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.89□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.89□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 HERC2O95714 4834 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 A0A1B0GUV1 79 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 FAM231BA6NCW3 169 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 CEBPGP53567 150 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 XGP55808 180 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 MPV17L2Q567V2 206 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 BAALCQ8WXS3 180 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 TMEM243Q9BU79 118 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 ZNF727A8MUV8 499 aa6.87□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 NCR2O95944 276 aa6.87□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.87□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 H7C423 109 aa6.86□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 K7EN84 100 aa6.86□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 PPP1R17O96001 155 aa6.86□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 RBX1P62877 108 aa6.86□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 ENHOQ6UWT2 76 aa6.86□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.86□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 PRR34Q9NV39 138 aa6.86□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 LECT2O14960 151 aa6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 AMTP48728 403 aa6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 GAGE6Q13070 117 aa6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 PEA15Q15121 130 aa6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 TSKUQ8WUA8 353 aa6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 OSTCQ9NRP0 149 aa6.85□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 A0A1B0GUT8 65 aa6.84□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 GAGE10A6NGK3 116 aa6.84□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 HLA-DQA1P01909 254 aa6.84□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 REG3AQ06141 175 aa6.84□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.84□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.84□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 Q5VSD8 79 aa6.84□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 LINC01551Q86U37 167 aa6.84□□□□□ -1.31
CD55-211ENST00000635614 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.83□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 RIGQ13278 110 aa6.83□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.83□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 CFAP161Q6P656 301 aa6.83□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 GATD1Q8NB37 220 aa6.83□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 GTSF1Q8WW33 167 aa6.83□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 BTF3L4Q96K17 158 aa6.83□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 HIGD1CA8MV81 97 aa6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 I3L3M4 83 aa6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 APCSP02743 223 aa6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 PMCHP20382 165 aa6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 Q6ZSA8 131 aa6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 MRAP2Q96G30 205 aa6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.82□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 A0A1B0GW15 77 aa6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 USP17L23D6RBM5 183 aa6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 WFDC2Q14508 124 aa6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 TMEM101Q96IK0 257 aa6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 ST20Q9HBF5 79 aa6.81□□□□□ -1.32
CD55-211ENST00000635614 NAT8Q9UHE5 227 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 181.8 ms