RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618698.4

CPEB1-217, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB1, Length 2,885 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-217ENST00000618698 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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CPEB1-217ENST00000618698 TSHBP01222 138 aa7.12□□□□□ -1.27
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CPEB1-217ENST00000618698 FAM223BA6NKX1 122 aa7.11□□□□□ -1.27
CPEB1-217ENST00000618698 H3BMM0 161 aa7.11□□□□□ -1.27
CPEB1-217ENST00000618698 ZNF56Q15929 161 aa7.11□□□□□ -1.27
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CPEB1-217ENST00000618698 C15orf32Q32M92 178 aa7.09□□□□□ -1.27
CPEB1-217ENST00000618698 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.09□□□□□ -1.27
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CPEB1-217ENST00000618698 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.08□□□□□ -1.28
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CPEB1-217ENST00000618698 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.07□□□□□ -1.28
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CPEB1-217ENST00000618698 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.07□□□□□ -1.28
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CPEB1-217ENST00000618698 A0A0B4J2C4 111 aa7.06□□□□□ -1.28
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CPEB1-217ENST00000618698 H7C423 109 aa7.06□□□□□ -1.28
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CPEB1-217ENST00000618698 GPHB5Q86YW7 130 aa7.06□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.06□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 CLEC2BQ92478 149 aa7.06□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.06□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.05□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.05□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.04□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 GNRH2O43555 120 aa7.04□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 NPC2P61916 151 aa7.04□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.04□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 ZNF876PQ49A33 203 aa7.04□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.04□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 JPT2Q9H910 190 aa7.04□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.03□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 TRBV12-3P01733 135 aa7.03□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 PRSS2P07478 247 aa7.03□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.03□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.03□□□□□ -1.28
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CPEB1-217ENST00000618698 LEPROTO15243 131 aa7.03□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 IGHV3-11P01762 117 aa7.03□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 C16orf92Q96LL3 132 aa7.03□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 TMEM101Q96IK0 257 aa7.02□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 C20orf173Q96LM9 149 aa7.02□□□□□ -1.28
CPEB1-217ENST00000618698 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.02□□□□□ -1.29
CPEB1-217ENST00000618698 TMEM223A0PJW6 202 aa7.02□□□□□ -1.29
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