RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	UBE2D1	P51668	147 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	LIMD2	Q9BT23	127 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	CR1	P17927	2039 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	PRX	Q9BXM0	1461 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	PIK3C2B	O00750	1634 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	PDE6H	Q13956	83 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	MYOM1	P52179	1685 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	MED13	Q9UHV7	2174 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594		A8MU10	97 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	C1orf137	Q5JT78	98 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	PI4KA	P42356	2102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	SLIT2	O94813	1529 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	MED12	Q93074	2177 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	CTSG	P08311	255 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	PYDC2	Q56P42	97 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594		Q6ZTI0	123 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	DMAC1	Q96GE9	116 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	MROH2A	A6NES4	1674 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594		F8WEM9	126 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	HRES1	P13985	223 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	LY6E	Q16553	131 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	C20orf197	Q8N268	126 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PAF1-208	ENST00000598594	TSC2	P49815	1807 aa		3.09	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	LAMC1	P11047	1609 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	NUPR2	A6NF83	97 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	RTL8C	O15255	209 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	KRTAP10-9	P60411	292 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF815P	A8K554	130 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	LRRC37A3	O60309	1634 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	GLI2	P10070	1586 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	DEFB134	Q4QY38	66 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	TVP23C	Q96ET8	276 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	CCL26	Q9Y258	94 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	WIZ	O95785	1651 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	RREB1	Q92766	1687 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	FAM223B	A6NKX1	122 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	HMGN4	O00479	90 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	PATE1	Q8WXA2	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	TET1	Q8NFU7	2136 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594		A0A1B0GWA3	101 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	COX8A	P10176	69 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	XAF1	Q6GPH4	301 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	IFT172	Q9UG01	1749 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	SHPRH	Q149N8	1683 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAF1-208	ENST00000598594	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		3.03	□□□□□ -1.92

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