RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-225	ENST00000593072	PHOX2A	O14813	284 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	CXCL1	P09341	107 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	ASIP	P42127	132 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.2	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRGC2	P03986	189 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	FABP4	P15090	132 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	CTRL	P40313	264 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072		Q6ZSA8	131 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	DLEU1	O43261	78 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	SNAI2	O43623	268 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072		F2Z2F3	143 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072		M0R381	172 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072		Q8N3U1	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1B0GUT8	65 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1B0GXF2	115 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	RS1	O15537	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	NTF3	P20783	257 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	CACNG7	P62955	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	TWIST1	Q15672	202 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	RASL10A	Q92737	203 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	SPX	Q9BT56	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFTUD2-225	ENST00000593072		M0R2P5	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	CAMP	P49913	170 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	RIG	Q13278	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	COTL1	Q14019	142 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	LELP1	Q5T871	98 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	PTH2	Q96A98	100 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	JPT2	Q9H910	190 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1B0GW15	77 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	ESD	P10768	282 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	PCP4	P48539	62 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	TIRAP	P58753	221 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	HBB	P68871	147 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	COX19	Q49B96	90 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EFTUD2-225	ENST00000593072	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.14	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms