RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	INS	P01308	110 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	PROK1	P58294	105 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0B4J2C4	111 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559		A4D1N5	150 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-53	P01767	116 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	PRB1	P04280	392 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	SFTA2	Q6UW10	78 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB1A1	P11684	91 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	FAM104A	Q969W3	186 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRN3-205	ENST00000563559	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	NACA	E9PAV3	2078 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0J9YXY3	114 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP10-9	P60411	292 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	FOXI1	Q12951	378 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559		Q96MF0	132 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TCL1B	O95988	128 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZSN1	163 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	RS1	O15537	224 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PRM2	P04554	102 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ERG28	Q9UKR5	140 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-33	P01772	117 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	AZU1	P20160	251 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	INSL3	P51460	131 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	TEN1	Q86WV5	123 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF843	Q8N446	348 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559		Q9UF83	564 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RRN3-205	ENST00000563559	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	STH	Q8IWL8	128 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXC	Q9NY87	97 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZSV7	163 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559		M0QXV9	152 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	LITAF	Q99732	161 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZUT4	128 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	XCL2	Q9UBD3	114 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	CHD6	Q8TD26	2715 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS2	P07478	247 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TIRAP	P58753	221 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559		Q1RN00	199 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	RNF183	Q96D59	192 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	FHL3	Q13643	280 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	MIA	Q16674	131 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM17B	O60830	172 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK8	P0C7L1	97 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559		H7C2G1	150 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN8	Q156A1	80 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RRN3-205	ENST00000563559	APC	P25054	2843 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A20	O43772	301 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.27	□□□□□ -0.29

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