RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	PDE6D	O43924	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304		P01737	135 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	CTRL	P40313	264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	GAGE6	Q13070	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	RMI2	Q96E14	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	IFNA1	P01562	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	RBX1	P62877	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	ELOB	Q15370	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	CRP	P02741	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	NTF3	P20783	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	CACNG7	P62955	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304		Q0VG73	95 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	PRSS1	P07477	247 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304		F2Z2F3	143 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	MIA	Q16674	131 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1B0GVG6	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304		H7C1H1	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	PANO1	I0J062	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	PKIA	P61925	76 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	REG3A	Q06141	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TWIST1	Q15672	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	TNXB	P22105	4242 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1B0GUV1	79 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	CEBPG	P53567	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	AMT	P48728	403 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	COTL1	Q14019	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZEB1-223	ENST00000561304	UBE2L6	O14933	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.5 ms