RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	FXYD3	Q14802	87 aa		1.27	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		1.27	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		1.27	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		1.27	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		1.27	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PATJ	Q8NI35	1801 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	COL4A6	Q14031	1691 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	NCOA2	Q15596	1464 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	APOC3	P02656	99 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	EDDM3B	P56851	147 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957		V9GYH0	126 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PPL	O60437	1756 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF14	Q15058	1648 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		1.26	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGXB3	Q12766	1538 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WTM6	91 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGN4	O00479	90 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL18	P55774	89 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	FXYD4	P59646	89 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB103A	P81534	67 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PEAK1	Q9H792	1746 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	RREB1	Q92766	1687 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	DIP2B	Q9P265	1576 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCC2	Q92887	1545 aa		1.25	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	MRC1	P22897	1456 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R17	O96001	155 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	UQCRH	P07919	91 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	IL9	P15248	144 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PMCHL1	Q16048	86 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF563	Q8TA94	476 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ST20	Q9HBF5	79 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957		R4GMQ9	66 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957		V9GYV3	84 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	TOP2B	Q02880	1626 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRF	P10586	1907 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		1.24	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPM0	123 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CAV3	P56539	151 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM11A	P58511	58 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAG11B	Q08648	103 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ADIRF	Q15847	76 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PCOTH	Q58A44	107 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZQY7	126 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SDK2	Q58EX2	2172 aa		1.23	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	NUMA1	Q14980	2115 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	CR1	P17927	2039 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCC1	P33527	1531 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JND7	137 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957		F2Z2F3	143 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ACYP1	P07311	99 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	EFNA4	P52798	201 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGN3	Q15651	99 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ETDB	Q3ZM63	59 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00208	Q96KT6	92 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		1.22	□□□□□ -2.21
AKAP13-223	ENST00000560957	HIGD1B	Q9P298	99 aa		1.22	□□□□□ -2.21

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