RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	PPP1R17	O96001	155 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	GAGE1	Q13065	139 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	GAGE4	Q13068	117 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	GAGE5	Q13069	117 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	COX19	Q49B96	90 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	AMN1	Q8IY45	258 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	RNF185	Q96GF1	192 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	PPBP	P02775	128 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2D3	P61077	147 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2D2	P62837	147 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312		Q9UF83	564 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	MT-ND6	P03923	174 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	ELOB	Q15370	118 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	ESRG	Q1W209	222 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	ATRAID	Q6UW56	229 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NUMB-231	ENST00000559312	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	LCE6A	A0A183	80 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	PHOX2A	O14813	284 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	LY6G6C	O95867	125 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	CKS2	P33552	79 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	LELP1	Q5T871	98 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	ORMDL3	Q8N138	153 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	YPEL4	Q96NS1	127 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	C20orf78	Q9BR46	151 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	ST20	Q9HBF5	79 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312		D6R8Y8	96 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312		K7EP13	123 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM18	Q96B42	140 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	KMT2A	Q03164	3969 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	SMKR1	H3BMG3	65 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	VCY	O14598	125 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	SIVA1	O15304	175 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	GAS8-AS1	O95177	125 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	NCR2	O95944	276 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	APCS	P02743	223 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	PKIA	P61925	76 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	COTL1	Q14019	142 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	PRELID3A	Q96N28	172 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	KIR2DL4	Q99706	377 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312		Q9H8V8	135 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312		I3L3M4	83 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TCAP	O15273	167 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	NPY	P01303	97 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	PMCH	P20382	165 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	TTC32	Q5I0X7	151 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		5.1	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms