RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 RASL11AQ6T310 242 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 GATD1Q8NB37 220 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 BTF3L4Q96K17 158 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 A0A087WTM6 91 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 S100A8P05109 93 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 RAB4AP20338 218 aa9.31□□□□□ -0.92
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CS-231ENST00000552222 UBE2D2P62837 147 aa9.31□□□□□ -0.92
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CS-231ENST00000552222 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 NIT2Q9NQR4 276 aa9.3□□□□□ -0.92
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CS-231ENST00000552222 LELP1Q5T871 98 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 GAS8-AS1O95177 125 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 RAB5BP61020 215 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 EREGO14944 169 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.24□□□□□ -0.93
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CS-231ENST00000552222 SIVA1O15304 175 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 NCR2O95944 276 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.24□□□□□ -0.93
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CS-231ENST00000552222 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.23□□□□□ -0.93
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CS-231ENST00000552222 PPP1R17O96001 155 aa9.23□□□□□ -0.93
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CS-231ENST00000552222 CKS2P33552 79 aa9.23□□□□□ -0.93
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CS-231ENST00000552222 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-231ENST00000552222 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.22□□□□□ -0.93
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CS-231ENST00000552222 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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CS-231ENST00000552222 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 K7EP13 123 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 TNFRSF6BO95407 300 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HLA-DQA1P01909 254 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 COTL1Q14019 142 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 ORMDL3Q8N138 153 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 C20orf78Q9BR46 151 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 I3L3M4 83 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 NPYP01303 97 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 NIT1Q86X76 327 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 PRELID3AQ96N28 172 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 VCYO14598 125 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 APCSP02743 223 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 MT-ND6P03923 174 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 PMCHP20382 165 aa9.18□□□□□ -0.94
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CS-231ENST00000552222 Q8N3U1 123 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST1H2BKO60814 126 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 TSHBP01222 138 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST1H2BJP06899 126 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST1H2BOP23527 126 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST1H2BBP33778 126 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST1H2BDP58876 126 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST1H2BCP62807 126 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-231ENST00000552222 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.17□□□□□ -0.94
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