RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TWIST1Q15672 202 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 C5orf52A6NGY3 159 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 A8MWL6 223 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 CTRLP40313 264 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 RAB14P61106 215 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 TRGC1P0CF51 173 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 UBE2D3P61077 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 UBE2D2P62837 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 ADIRFQ15847 76 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 Q5VSD8 79 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 ISOC2Q96AB3 205 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 OSTCQ9NRP0 149 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 NAT8Q9UHE5 227 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 A0A087WWC5 75 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 M0QY20 66 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 IFITM2Q01629 132 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 VCYO14598 125 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 TSKUQ8WUA8 353 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 FRZBQ92765 325 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 CNFNQ9BYD5 112 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 V9GYV3 84 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 HIGD1CA8MV81 97 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 TMEM262E9PQX1 116 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 H7C1H1 209 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 K7EP13 123 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 RASL11AQ6T310 242 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 NFE4Q86UQ8 179 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 BORCS7Q96B45 105 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 Q9HAA7 133 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GUT8 65 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 CLLU1Q5K131 121 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 NIT1Q86X76 327 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 GATD1Q8NB37 220 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 NUP35Q8NFH5 326 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 NIT2Q9NQR4 276 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 A0A087WX48 190 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 FAM231BA6NCW3 169 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 KLK12Q9UKR0 248 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 PSCAO43653 123 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 GAS8-AS1O95177 125 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 RIGQ13278 110 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 XGP55808 180 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 GAGE6Q13070 117 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 A0A087WTM6 91 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 RAB4AP20338 218 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 MPV17L2Q567V2 206 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 AMN1Q8IY45 258 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 Q8N976 141 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 UBE2WQ96B02 151 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 RNF185Q96GF1 192 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 SMKR1H3BMG3 65 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 LAGE3Q14657 143 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 ELOBQ15370 118 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 IQCJQ1A5X6 159 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 MAJINQ3KP22 176 aa6.4□□□□□ -1.38
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