RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 IFNA1P01562 189 aa7.58□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 HLA-DQA1P01909 254 aa7.58□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 REG3AQ06141 175 aa7.58□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.58□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX46H3BTG2 121 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 GATD1Q8NB37 220 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 GTSF1Q8WW33 167 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.57□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 XKRY2A2RUG3 117 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 TRGC1P0CF51 173 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM243Q9BU79 118 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 BIN3Q9NQY0 253 aa7.56□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.54□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 TWIST1Q15672 202 aa7.54□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 OXTP01178 125 aa7.53□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM231BA6NCW3 169 aa7.52□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 GAS8-AS1O95177 125 aa7.52□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 COTL1Q14019 142 aa7.52□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.52□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 C15orf56Q8N910 161 aa7.52□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 hDV102S1A0JD36 115 aa7.51□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM250H0YL14 139 aa7.51□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 AMTP48728 403 aa7.51□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.51□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.5□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.49□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.49□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 NCR2O95944 276 aa7.49□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 CHTF8P0CG12 524 aa7.49□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 TNXBP22105 4242 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087WYN8 130 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2L6O14933 153 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 MT1HL1P0DM35 61 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 ESDP10768 282 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 BLOC1S1P78537 153 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF185Q96GF1 192 aa7.48□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 A8MWL6 223 aa7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 H7C423 109 aa7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 FGF6P10767 208 aa7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXI1Q12951 378 aa7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 CT83Q5H943 113 aa7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX261Q6UWH6 196 aa7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01551Q86U37 167 aa7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CLSTN3-211ENST00000541667 TSHBP01222 138 aa7.46□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.46□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.46□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.46□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 I3L3M4 83 aa7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB4AP20338 218 aa7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 COX6A2Q02221 97 aa7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 TSKUQ8WUA8 353 aa7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.45□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 APCSP02743 223 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 PMCHP20382 165 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 CFAP161Q6P656 301 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM210AQ96ND0 272 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 OSTCQ9NRP0 149 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GUT8 65 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 HIGD1CA8MV81 97 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 CEBPGP53567 150 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZRU5 148 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 V9GYV3 84 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-211ENST00000541667 C9JQL5 133 aa7.42□□□□□ -1.22
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