RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 GAGE6Q13070 117 aa9□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 C18orf15Q96N68 181 aa9□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 HIGD1CA8MV81 97 aa8.99□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 HERV-K104P63124 156 aa8.99□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 WFDC2Q14508 124 aa8.99□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 CASC10Q5T4H9 136 aa8.99□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 GAGE7O76087 117 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 GAGE12FP0CL80 117 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 GAGE12GP0CL81 117 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 GAGE12IP0CL82 117 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 CAMPP49913 170 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 RASL10AQ92737 203 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 M0R2P5 195 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 ASIPP42127 132 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 PTH2Q96A98 100 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 MUC4Q99102 2169 aa8.98□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 P01737 135 aa8.97□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 SPINK8P0C7L1 97 aa8.97□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.96□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 NUPR2A6NF83 97 aa8.96□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 E9PLD3 99 aa8.96□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.96□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 ETDBQ3ZM63 59 aa8.96□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 CDIP1Q9H305 208 aa8.96□□□□□ -0.97
RPUSD4-208ENST00000533628 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.96□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 H3BVH4 76 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 ATP5G1P05496 136 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 MED14OSP0DP75 135 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 HIGD1BQ9P298 99 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 PRO0461Q9UI25 63 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 NCR2O95944 276 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 CT83Q5H943 113 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.95□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF876PQ49A33 203 aa8.94□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 Q6ZUT4 128 aa8.94□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.94□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 A8MWL6 223 aa8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLC6P0CF74 106 aa8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 HTN3P15516 51 aa8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 C20orf78Q9BR46 151 aa8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 FXYD2P54710 66 aa8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 RS1O15537 224 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 NXPH4O95158 308 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 MT-ATP8P03928 68 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 GAGE13Q4V321 117 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 TM2D2Q9BX73 214 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 F5H768 121 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 FOXI1Q12951 378 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 FHL2Q14192 279 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 ODF1Q14990 250 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 SYT8Q8NBV8 401 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 APLNQ9ULZ1 77 aa8.92□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 NACAE9PAV3 2078 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 B5MCH6 92 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLL5B9A064 214 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 APOMO95445 188 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV3-53P01767 116 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 GCSHP23434 173 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 XGP55808 180 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.91□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 H3BMG7 143 aa8.9□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 K7ERJ3 54 aa8.9□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 PCP2Q8IVA1 136 aa8.9□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 JPT2Q9H910 190 aa8.9□□□□□ -0.98
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A1B0GW15 77 aa8.9□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.9□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 TCTAP57738 103 aa8.89□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.89□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 TENM2Q9NT68 2774 aa8.89□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 A8MWV9 139 aa8.89□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 M0R381 172 aa8.89□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.89□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A096LNJ9 63 aa8.88□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 CRYGDP07320 174 aa8.88□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 CACNG7P62955 275 aa8.88□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.88□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 CNFNQ9BYD5 112 aa8.88□□□□□ -0.99
RPUSD4-208ENST00000533628 VCX2Q9H322 139 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.2 ms