RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532928.1

DDX25-208, Transcript of DEAD-box helicase 25, human

TSL 3

Gene DDX25, Length 726 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX25-208	ENST00000532928	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	RBX1	P62877	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	GAGE6	Q13070	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	MIA	Q16674	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928		P01737	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	CEBPG	P53567	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	RAB4B	P61018	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928		Q6ZRU5	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928		A0A087WYN8	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928		F2Z2F3	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928		F5H697	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	SLPI	P03973	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928		A8MWL6	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	PHOX2A	O14813	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	NTF3	P20783	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	REG3A	Q06141	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	CT83	Q5H943	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928		V9GYV3	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDX25-208	ENST00000532928	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	CTRL	P40313	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	CACNG7	P62955	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	MGP	P08493	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	PKIA	P61925	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	COX6A2	Q02221	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	ADIRF	Q15847	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	LPA	P08519	4548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928		M0QY20	66 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928		A0A1B0GUT8	65 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	TWIST1	Q15672	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928		A0A1B0GUV1	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928		F8W036	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX25-208	ENST00000532928	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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