RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527052.5

NOD2-204, Transcript of nucleotide binding oligomerization domain containing 2, human

TSL 1 (best)

Gene NOD2, Length 338 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOD2-204	ENST00000527052	PKIA	P61925	76 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	ATRAID	Q6UW56	229 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052		A0A1B0GW15	77 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	TRGC1	P0CF51	173 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	ZNF56	Q15929	161 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	TPPP3	Q9BW30	176 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	HIGD1C	A8MV81	97 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	RIG	Q13278	110 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	C14orf177	Q52M58	125 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	TMEM262	E9PQX1	116 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	CRP	P02741	224 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	SMIM17	P0DL12	118 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	S100A1	P23297	94 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	AP1S3	Q96PC3	154 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	CNFN	Q9BYD5	112 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052		A0A1B0GUT8	65 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	GZMB	P10144	247 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052		J3QL48	77 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	TWIST1	Q15672	202 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	SCX	Q7RTU7	201 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	GTSF1	Q8WW33	167 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NOD2-204	ENST00000527052		F5H697	171 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	COX19	Q49B96	90 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	LINC01620	Q4KN68	170 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	MPV17L2	Q567V2	206 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	RASL11A	Q6T310	242 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	NUP35	Q8NFH5	326 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		9.64	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	NTF3	P20783	257 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	MIA	Q16674	131 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	ENHO	Q6UWT2	76 aa		9.63	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		9.62	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	HBB	P68871	147 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		9.61	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052		H7C1H1	209 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	PRR34	Q9NV39	138 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	USP17L23	D6RBM5	183 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	HLA-DQA1	P01909	254 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	SST	P61278	116 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NOD2-204	ENST00000527052	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	RBX1	P62877	108 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052		M0QY20	66 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	ATP6V1G1	O75348	118 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	PPP1R17	O96001	155 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	MGP	P08493	103 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	MT-ND6	P03923	174 aa		9.56	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	CAMP	P49913	170 aa		9.56	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	GAGE6	Q13070	117 aa		9.56	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		9.56	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	GATD1	Q8NB37	220 aa		9.56	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		9.55	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052		A0A1B0GXF2	115 aa		9.55	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		9.55	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	MRAP2	Q96G30	205 aa		9.55	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	PPBP	P02775	128 aa		9.54	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	PRSS1	P07477	247 aa		9.54	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	9.54	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		9.54	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		9.53	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	REG3A	Q06141	175 aa		9.53	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		9.53	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		9.53	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		9.53	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	TMEM243	Q9BU79	118 aa		9.53	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		9.53	□□□□□ -0.88
NOD2-204	ENST00000527052		A0A1B0GUV1	79 aa		9.52	□□□□□ -0.89
NOD2-204	ENST00000527052	OXT	P01178	125 aa		9.52	□□□□□ -0.89
NOD2-204	ENST00000527052	NIT2	Q9NQR4	276 aa		9.52	□□□□□ -0.89
NOD2-204	ENST00000527052	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		9.51	□□□□□ -0.89

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