RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 KIR2DL4Q99706 377 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 NIT1Q86X76 327 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL32P62910 135 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 BAGE3Q86Y29 109 aa15.6■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 AMTP48728 403 aa15.6■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 Q8N3U1 123 aa15.6■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL18P55774 89 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 FA2HQ7L5A8 372 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.59■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 PMCHL1Q16048 86 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.58■□□□□ 0.09
TSNARE1-208ENST00000524325 NUPR1O60356 82 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LELP1Q5T871 98 aa15.58■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00614P0C842 121 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00310P59036 64 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 Q0VG73 95 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.57■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TCTAP57738 103 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 GAGE6Q13070 117 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SERF1AO75920 110 aa15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL39P62891 51 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM243Q9BU79 118 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 NDUFA6P56556 154 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LAGE3Q14657 143 aa15.55■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM262E9PQX1 116 aa15.54■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ESDP10768 282 aa15.54■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TIRAPP58753 221 aa15.54■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 AP5S1Q9NUS5 200 aa15.54■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAH1Q9P2D7 4330 aa15.54■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB5BP61020 215 aa15.53■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 BTF3P20290 206 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM97Q5BJF2 176 aa15.52■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM19A2Q8N3H0 131 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 Q8N976 141 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC01546A6NGU7 62 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV3-30P01768 117 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV3-33P01772 117 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.51■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS13DQ5THJ4 4388 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2L6O14933 153 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ORMDL2Q53FV1 153 aa15.5■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A096LNJ9 63 aa15.49■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 LY6G6CO95867 125 aa15.49■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 MPV17L2Q567V2 206 aa15.49■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 C2orf66Q6UXQ4 117 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 Q9H8V8 135 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FGF6P10767 208 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 HSBP1O75506 76 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 PDZD11Q5EBL8 140 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 SIVA1O15304 175 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 UPK3BQ9BT76 320 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-208ENST00000524325 K7EMI3 77 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 RBX1P62877 108 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A087WX48 190 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00476Q8WZB0 136 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 LGALS9CQ6DKI2 356 aa15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CYSLTR1Q9Y271 337 aa15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 TOMM6Q96B49 74 aa15.43■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 KMT2AQ03164 3969 aa15.42■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.42■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 HBDP02042 147 aa15.42■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00173Q6ZV60 143 aa15.42■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM104AQ969W3 186 aa15.42■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAH10OSP0CZ25 163 aa15.41■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.41■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ALMS1Q8TCU4 4167 aa15.41■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC01556Q5JQF7 62 aa15.4■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM18Q96B42 140 aa15.4■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa15.4■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 KLK12Q9UKR0 248 aa15.4■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 M0R2N4 97 aa15.4■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 Q6ZUT4 128 aa15.4■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 SCGB3A1Q96QR1 104 aa15.4■□□□□ 0.06
TSNARE1-208ENST00000524325 IGIPA6NJ69 53 aa15.39■□□□□ 0.05
TSNARE1-208ENST00000524325 H7C423 109 aa15.39■□□□□ 0.05
TSNARE1-208ENST00000524325 S100A6P06703 90 aa15.39■□□□□ 0.05
TSNARE1-208ENST00000524325 FABP4P15090 132 aa15.39■□□□□ 0.05
TSNARE1-208ENST00000524325 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa15.39■□□□□ 0.05
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5A1Q8NGJ0 315 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms