RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 PYY3Q5JQD4 70 aa9.39□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.39□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.39□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 A0A1B0GXF2 115 aa9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 HSPG2P98160 4391 aa9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.37□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00694P0DN24 101 aa9.37□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 IQCJQ1A5X6 159 aa9.37□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 GATD1Q8NB37 220 aa9.37□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.37□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.37□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 GAGE12JA6NER3 117 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 H7C1H1 209 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 GAGE1Q13065 139 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 GAGE4Q13068 117 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 GAGE5Q13069 117 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 GAGE13Q4V321 117 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 Q8N3U1 123 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 TSTD3H0UI37 97 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 EVI2AP22794 236 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 SSTP61278 116 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 MRAP2Q96G30 205 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.34□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.34□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 SERF1AO75920 110 aa9.34□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.34□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.34□□□□□ -0.91
ITGA3-214ENST00000514834 IGHV3-30P01768 117 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 IGHV3-33P01772 117 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 CKS2P33552 79 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 PKIAP61925 76 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF56Q15929 161 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 ORMDL3Q8N138 153 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 K7EP13 123 aa9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 RAB4AP20338 218 aa9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 LELP1Q5T871 98 aa9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 A0A087WTM6 91 aa9.31□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.31□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 F5H697 171 aa9.31□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 TCAPO15273 167 aa9.31□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 SCGB1D1O95968 90 aa9.31□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 UBE2D3P61077 147 aa9.31□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 UBE2D2P62837 147 aa9.31□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 NFE4Q86UQ8 179 aa9.31□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 M0QY20 66 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 CDK2AP2O75956 126 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 G0S2P27469 103 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 AMTP48728 403 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 Q9HAA7 133 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 HSBP1O75506 76 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 PMCHP20382 165 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 NUPR1O60356 82 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 MGPP08493 103 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 AMN1Q8IY45 258 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 PRELID3AQ96N28 172 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-214ENST00000514834 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 K7EMI3 77 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 C20orf78Q9BR46 151 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 LINC01549A6NIU2 74 aa9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00310P59036 64 aa9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP10-1P60331 282 aa9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00587B1AMM8 73 aa9.25□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 D6R8Y8 96 aa9.25□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 EREGO14944 169 aa9.25□□□□□ -0.93
ITGA3-214ENST00000514834 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms