RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 RRN3P1Q2M238 152 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 PDZD2O15018 2839 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZTI0 123 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 TAL2Q16559 108 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 INAFM1C9JVW0 142 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV1-51P01701 117 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF479Q96JC4 524 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE12BA1L429 117 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 RS1O15537 224 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE7O76087 117 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE12FP0CL80 117 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE12GP0CL81 117 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE12IP0CL82 117 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 J3QQQ9 107 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 TM2D2Q9BX73 214 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PPM0 123 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE12JA6NER3 117 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFA7O95182 113 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE4Q13068 117 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE5Q13069 117 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE13Q4V321 117 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 C12orf74Q32Q52 190 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 A6NJY4 79 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 APOMO95445 188 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF151Q2KHN1 245 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.96□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 PTH2Q96A98 100 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 K7EP34 96 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 SFTA2Q6UW10 78 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 NFE4Q86UQ8 179 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 K7EQD1 137 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 C16orf74Q96GX8 76 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZUT4 128 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 LEPROTO15243 131 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM223A0PJW6 202 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLL5B9A064 214 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 PRSS2P07478 247 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB130BP0DP73 79 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB130AP0DP74 79 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0J9YY99 117 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2L6O14933 153 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-3P60369 221 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 SPINK8P0C7L1 97 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 AMELXQ99217 191 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms