RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PDZD2O15018 2839 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 A0A0G2JQZ4 141 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 E7EUB6 86 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CDC42EP2O14613 210 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TRACP01848 142 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CD14P08571 375 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 DEFB133Q30KQ1 61 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PSMF1Q92530 271 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TVP23CQ96ET8 276 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.57□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 SPAG17Q6Q759 2223 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 A0A087WSZ3 146 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 E7EQL1 145 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 J3QRE1 110 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 ETV6P41212 452 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 FXYD6P3P58550 94 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PCBD1P61457 104 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TPRXLQ17RH7 258 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CLLU1Q5K131 121 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 SNX29P2Q8IUI4 249 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 Q8N2B8 174 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 ACBD7Q8N6N7 88 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 DEFB124Q8NES8 71 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 RAB37Q96AX2 223 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 C14orf144Q96I85 54 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CMC2Q9NRP2 79 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 A0A0G2JMM0 328 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PPB8 328 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 KIR3DP1A8MWS1 328 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 J3QLW9 94 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CORTO00230 105 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 F8P00451 2351 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 COL4A2P08572 1712 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 OR5AS1Q8N127 324 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TSLPQ969D9 159 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 MUCL1Q96DR8 90 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 SPG11Q96JI7 2443 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 RERGLQ9H628 205 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 HIVEP1P15822 2718 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.55□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 GYPBP06028 91 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PYYP10082 97 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 FGF7P21781 194 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CAV3P56539 151 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 PPP3R1P63098 170 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 ATOH7Q8N100 152 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 OTOSQ8NHW6 89 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 ZNF563Q8TA94 476 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 DPH3Q96FX2 82 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 Q96M85 177 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 V9GYH0 126 aa2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.54□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 EML5Q05BV3 1969 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 NCKAP5O14513 1909 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 A6NN06 94 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 RBP4P02753 201 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 IL7P13232 177 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 CKS2P33552 79 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 DCDP81605 110 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 INSL4Q14641 139 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 LINC01590Q5TEZ4 76 aa2.53□□□□□ -2
STRADB-210ENST00000498648 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.53□□□□□ -2
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