RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM262E9PQX1 116 aa8.43□□□□□ -1.06
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C9orf16-202ENST00000486420 APCSP02743 223 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 MT-ND6P03923 174 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 AMTP48728 403 aa8.43□□□□□ -1.06
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C9orf16-202ENST00000486420 TMEM18Q96B42 140 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1B0GUV1 79 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf16-202ENST00000486420 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
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C9orf16-202ENST00000486420 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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C9orf16-202ENST00000486420 FCER1GP30273 86 aa8.41□□□□□ -1.06
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C9orf16-202ENST00000486420 PSCAO43653 123 aa8.4□□□□□ -1.06
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C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3-33P01772 117 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 MIAQ16674 131 aa8.39□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 D6R8Y8 96 aa8.38□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 TNFRSF6BO95407 300 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 RAB5AP20339 215 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 PRELID3AQ96N28 172 aa8.38□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.37□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 RBX1P62877 108 aa8.36□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.36□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 MPV17L2Q567V2 206 aa8.35□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 PRR34Q9NV39 138 aa8.35□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 TSHBP01222 138 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 ESDP10768 282 aa8.34□□□□□ -1.07
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C9orf16-202ENST00000486420 C14orf177Q52M58 125 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 UBE2WQ96B02 151 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf16-202ENST00000486420 SMKR1H3BMG3 65 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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C9orf16-202ENST00000486420 Q9HAA7 133 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 NPSP0C0P6 89 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 FGF6P10767 208 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 REG3AQ06141 175 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 PKHD1P08F94 4074 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 NPYP01303 97 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 Q8N8P6 123 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 Q8N976 141 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.31□□□□□ -1.08
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C9orf16-202ENST00000486420 DNAH2Q9P225 4427 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 TNP2Q05952 138 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1B0GVY2 172 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 GAS8-AS1O95177 125 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 RAB5BP61020 215 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 ENHOQ6UWT2 76 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf16-202ENST00000486420 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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