RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479325.1

RUNX1-215, Transcript of runt related transcription factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene RUNX1, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNX1-215	ENST00000479325	IGF2R	P11717	2491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325		A0A0J9YXV3	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	SNCG	O76070	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	PRSS2	P07478	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	HTN1	P15515	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	CKS1B	P61024	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325		Q6YL49	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUNX1-215	ENST00000479325	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325		A0A0J9YXY3	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325		H3BMM0	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	PF4	P02776	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	HERVK_113	P63121	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	MIA	Q16674	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	RNF183	Q96D59	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	AMELX	Q99217	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325		A8MTW9	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325		H3BT86	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	UBE2L6	O14933	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	EDN2	P20800	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	STH	Q8IWL8	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	ATRX	P46100	2492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	NDUFA1	O15239	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	RS1	O15537	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TIRAP	P58753	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325		Q6ZUT4	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	HERV-K104	P63124	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325		Q8N2B8	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325		K7EQD1	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	INSL3	P51460	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RUNX1-215	ENST00000479325	TRIAP1	O43715	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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