RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRP	P02741	224 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMT	P48728	403 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	COTL1	Q14019	142 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM243	Q9BU79	118 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TM2D2	Q9BX73	214 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADCYAP1	P18509	176 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB4A	P20338	218 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELOB	Q15370	118 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLLU1	Q5K131	121 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSHB	P01222	138 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	XG	P55808	180 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	RIG	Q13278	110 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01620	Q4KN68	170 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	FRZB	Q92765	325 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	RMI2	Q96E14	147 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1B0GXF2	115 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	APCS	P02743	223 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCSH	P23434	173 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAMP	P49913	170 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB14	P61106	215 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKIA	P61925	76 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	REG3A	Q06141	175 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q0VG73	95 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	NRAC	Q8N912	160 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MIA	Q16674	131 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRAP2	Q96G30	205 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	COX11	Q9Y6N1	276 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1B0GUV1	79 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2L6	O14933	153 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ST20	Q9HBF5	79 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959		I3L3M4	83 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGF6	P10767	208 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ESD	P10768	282 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PMCH	P20382	165 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	HBB	P68871	147 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q8N1X5	172 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		7.25	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7.25	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959		D6R8Y8	96 aa		7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPY	P01303	97 aa		7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRSS1	P07477	247 aa		7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZSA8	131 aa		7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	COMMD7	Q86VX2	200 aa		7.24	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1B0GW15	77 aa		7.23	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM218	A2RU14	115 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959		H7C423	109 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP1R2P9	O14990	202 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFRSF6B	O95407	300 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		7.21	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959		F8W036	122 aa		7.21	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	CKS2	P33552	79 aa		7.21	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	UQCC3	Q6UW78	93 aa		7.21	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	C15orf56	Q8N910	161 aa		7.21	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.21	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAT1	Q14517	4588 aa		7.21	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC00862	A6NCI5	91 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT-ND4L	P03901	98 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	S100A8	P05109	93 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	FCER1G	P30273	86 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q5VSD8	79 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZUT4	128 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26

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