RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462130.1

HDLBP-230, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-230ENST00000462130 UBE2D3P61077 147 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 UBE2D2P62837 147 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 Q9HAA7 133 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 PPP1R2P9O14990 202 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00694P0DN24 101 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 GATD1Q8NB37 220 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 SEC11CQ9BY50 192 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 GAS8-AS1O95177 125 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 RAB4AP20338 218 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 TIRAPP58753 221 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 LELP1Q5T871 98 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 RASL11AQ6T310 242 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 Q8N814 137 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 RNF185Q96GF1 192 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 NIT2Q9NQR4 276 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 H7C1H1 209 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 IGHV3-30P01768 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 IGHV3-33P01772 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 AMN1Q8IY45 258 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 SMKR1H3BMG3 65 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 TM2D2Q9BX73 214 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-230ENST00000462130 A0A087WWC5 75 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM262E9PQX1 116 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 A0A1B0GXF2 115 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 APOC3P02656 99 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 A0A1B0GW15 77 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 NCR2O95944 276 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 HBBP68871 147 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 LAGE3Q14657 143 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 ST20Q9HBF5 79 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 LECT2O14960 151 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 S100A8P05109 93 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 PMCHP20382 165 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 CKS2P33552 79 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 GAGE6Q13070 117 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 NIT1Q86X76 327 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 MRAP2Q96G30 205 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 BTF3L4Q96K17 158 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 IMMP2LQ96T52 175 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 WFDC2Q14508 124 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 KLK12Q9UKR0 248 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 A0A087WX48 190 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 I3L3M4 83 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 COTL1Q14019 142 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 IQCJQ1A5X6 159 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 NRACQ8N912 160 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-230ENST00000462130 COX11Q9Y6N1 276 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.1 ms