RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 MT1HL1P0DM35 61 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 CEBPGP53567 150 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 PEA15Q15121 130 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 LRP2P98164 4655 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 M0QY20 66 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 H7C1H1 209 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM243Q9BU79 118 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.44□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 IGLC6P0CF74 106 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 CENPWQ5EE01 88 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 UQCC3Q6UW78 93 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 DPH3Q96FX2 82 aa7.43□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 A0A087WYN8 130 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 UBE2L6O14933 153 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 ATP6V1G1O75348 118 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 P01737 135 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 SLPIP03973 132 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 WDR73Q6P4I2 378 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 RASL11AQ6T310 242 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZRU5 148 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 CACNG7P62955 275 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 C11orf52Q96A22 123 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GUV1 79 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM218A2RU14 115 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 F8W036 122 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 PHOX2AO14813 284 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 PDE6DO43924 150 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 AMTP48728 403 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 C15orf56Q8N910 161 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 RNF185Q96GF1 192 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-210ENST00000453030 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 TRGC1P0CF51 173 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 ADCYAP1P18509 176 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 GNG4P50150 75 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 COTL1Q14019 142 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 NIT2Q9NQR4 276 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 XKRY2A2RUG3 117 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF727A8MUV8 499 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 COX6A2Q02221 97 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 C7orf33Q8WU49 177 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 F2Z2F3 143 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM250H0YL14 139 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 NTF3P20783 257 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 MAJINQ3KP22 176 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 APOC3P02656 99 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 CTRLP40313 264 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 GTSF1Q8WW33 167 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 ODF1Q14990 250 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 TWIST1Q15672 202 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 CFAP161Q6P656 301 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 GATD1Q8NB37 220 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM12Q96EX1 92 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 SEC11CQ9BY50 192 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 S100A1P23297 94 aa7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 ADIRFQ15847 76 aa7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 STPG4Q8N801 248 aa7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 NAT8Q9UHE5 227 aa7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-210ENST00000453030 A0A096LNI7 61 aa7.33□□□□□ -1.24
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