RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 CXCL5P42830 114 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG11BQ08648 103 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TOMM6Q96B49 74 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.45□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 CRYGBP07316 175 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf70A6NJV1 201 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 PIP4P1Q86T03 277 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC2BQ92478 149 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 DIRC1Q969H9 104 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.44□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX22C9J3V5 150 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 PTH2Q96A98 100 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 GPHB5Q86YW7 130 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE6GP18545 87 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087WW49 117 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00643Q86TS7 51 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 KLK12Q9UKR0 248 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB1P60022 68 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 PCSK5Q92824 1860 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2AP49459 152 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 E7EUB6 86 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 NCR3O14931 201 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 PROP1O75360 226 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 G3V4G9 280 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 MDFICQ9P1T7 246 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 PRO0255Q9UI72 69 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 TM2D2Q9BX73 214 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0J9YX75 114 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV12-3P01733 135 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB135Q30KP9 77 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 Q8N7P7 452 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM89A2RUT3 159 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 SVIPQ8NHG7 77 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 MTORP42345 2549 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GXF2 115 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 MIAQ16674 131 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 POLQO75417 2590 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV2-14P01704 120 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 MYCNOSP40205 109 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZUT4 128 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 NCKAP5O14513 1909 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 BPY2O14599 106 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB4AO15263 64 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 TCL1BO95988 128 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 COX7BP24311 80 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 F8W735 103 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf197Q8N268 126 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 H0Y9J4 135 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0J9YXY3 114 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 BRK1Q8WUW1 75 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-202ENST00000426333 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA25Q9BR10 227 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-202ENST00000426333 MSMPQ1L6U9 139 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-202ENST00000426333 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms