RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

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Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 IGHV3-11P01762 117 aa16.01■□□□□ 0.15
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CLDN5-201ENST00000403084 HERVK_113P63121 156 aa16■□□□□ 0.15
CLDN5-201ENST00000403084 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16■□□□□ 0.15
CLDN5-201ENST00000403084 C5orf38Q86SI9 138 aa16■□□□□ 0.15
CLDN5-201ENST00000403084 H3BUA1 57 aa15.99■□□□□ 0.15
CLDN5-201ENST00000403084 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CLDN5-201ENST00000403084 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa15.98■□□□□ 0.15
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CLDN5-201ENST00000403084 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.98■□□□□ 0.15
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CLDN5-201ENST00000403084 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.97■□□□□ 0.15
CLDN5-201ENST00000403084 MED13LQ71F56 2210 aa15.96■□□□□ 0.14
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CLDN5-201ENST00000403084 C5orf47Q569G3 176 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN5-201ENST00000403084 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLDN5-201ENST00000403084 IGKV3-20P01619 116 aa15.91■□□□□ 0.14
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CLDN5-201ENST00000403084 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN5-201ENST00000403084 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.91■□□□□ 0.14
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CLDN5-201ENST00000403084 SPINK13Q1W4C9 94 aa15.9■□□□□ 0.14
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CLDN5-201ENST00000403084 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.87■□□□□ 0.13
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CLDN5-201ENST00000403084 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN5-201ENST00000403084 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.86■□□□□ 0.13
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CLDN5-201ENST00000403084 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN5-201ENST00000403084 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN5-201ENST00000403084 IGLV1-40P01703 118 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN5-201ENST00000403084 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
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CLDN5-201ENST00000403084 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.85■□□□□ 0.13
CLDN5-201ENST00000403084 Q9H8V8 135 aa15.85■□□□□ 0.13
CLDN5-201ENST00000403084 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa15.85■□□□□ 0.13
CLDN5-201ENST00000403084 CCL21O00585 134 aa15.85■□□□□ 0.13
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CLDN5-201ENST00000403084 Q9UF83 564 aa15.83■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 UBTD1Q9HAC8 227 aa15.82■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 CHD6Q8TD26 2715 aa15.81■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 ATP5J2P56134 94 aa15.81■□□□□ 0.12
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CLDN5-201ENST00000403084 Q6ZSN1 163 aa15.8■□□□□ 0.12
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CLDN5-201ENST00000403084 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 RBMY1CP0DJD4 496 aa15.79■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.79■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1W2PPR1 153 aa15.79■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 MALP21145 153 aa15.79■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.79■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 CFHR3Q02985 330 aa15.79■□□□□ 0.12
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
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