RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPRR1AP35321 89 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 Q8IZM0 81 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 NPFFO15130 113 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCL18P55774 89 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 K7ERU9 68 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 ARPC5O15511 151 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SNCGO76070 127 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 USH2AO75445 5202 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SIX6O95475 246 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCE1O60756 84 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 KCNRGQ8N5I3 272 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 SDF2Q99470 211 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 R4GMQ9 66 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-641P-201ENST00000384006 USF3Q68DE3 2245 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 LAMC1P11047 1609 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 S100A3P33764 101 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPAG11BQ08648 103 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 MT4P47944 62 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 LZICQ8WZA0 190 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 SEC11CQ9BY50 192 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 COPZ2Q9P299 210 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 HERC2O95714 4834 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRDM2Q13029 1718 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 RYR1P21817 5038 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 I3L2K1 104 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 M0R135 149 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP1R17O96001 155 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 COPZ1P61923 177 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 LRP6O75581 1613 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 CEP152O94986 1710 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 HCG22E2RYF7 251 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 DPH3Q96FX2 82 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 MYH8P13535 1937 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 TSTD1Q8NFU3 115 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 PI4KAP42356 2102 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 COL6A3P12111 3177 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 MRC1P22897 1456 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 HERC1Q15751 4861 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPRR2BP35325 72 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 HAMPP81172 84 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 SMCO1Q147U7 214 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 APC2O95996 2303 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 AQP10Q96PS8 301 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 AMELXQ99217 191 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 COX17Q14061 63 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 C10orf128Q5T292 105 aa-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms