RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 DCANP1Q8TF63 244 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.53□□□□□ -1.68
CCR6-201ENST00000341935 KNCNA6PVL3 124 aa4.52□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 Q0VG73 95 aa4.52□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 ERCC8Q13216 396 aa4.52□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.52□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 K7EQG2 157 aa4.52□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 ASIPP42127 132 aa4.52□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.52□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 LEPROTL1O95214 131 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 AMN1Q8IY45 258 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 CEND1Q8N111 149 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 C8orf49Q96NF6 230 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 F8P00451 2351 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 PAX4O43316 350 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.51□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 OSTCQ9NRP0 149 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 TMEM258P61165 79 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 Q8TAT8 98 aa4.51□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 PRR25Q96S07 402 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 ZNF492Q9P255 531 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 V9GYV3 84 aa4.51□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 PSMG4Q5JS54 123 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 Q5XG85 94 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 ZNF138P52744 262 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 DEFB1P60022 68 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 Q6Q795 121 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 TEN1Q86WV5 123 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 COX8AP10176 69 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.5□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 NPC2P61916 151 aa4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 OR5AL1P0C617 328 aa4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.49□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.49□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 NFE4Q86UQ8 179 aa4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.49□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 A0A0J9YX75 114 aa4.48□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 IGLL5B9A064 214 aa4.48□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 SH2D1AO60880 128 aa4.48□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 IGLV1-51P01701 117 aa4.48□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 HLA-DQA1P01909 254 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 ZNF747Q9BV97 191 aa4.48□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.48□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 K7EMI3 77 aa4.48□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 LINC00310P59036 64 aa4.48□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 PRR9Q5T870 116 aa4.47□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.47□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.47□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.47□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.47□□□□□ -1.69
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CCR6-201ENST00000341935 RRN3P1Q2M238 152 aa4.47□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 ODF3Q96PU9 254 aa4.47□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 COX7CP15954 63 aa4.46□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.46□□□□□ -1.69
CCR6-201ENST00000341935 HIGD1BQ9P298 99 aa4.46□□□□□ -1.69
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