RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 DCANP1Q8TF63 244 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 IMUPQ9GZP8 106 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 ZNF56Q15929 161 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 RNF152Q8N8N0 203 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 ACYP1P07311 99 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 LMO4P61968 165 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TMEM126AQ9H061 195 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 ZNF580Q9UK33 172 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TMEM219Q86XT9 240 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 IGHG2P01859 326 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 SPXQ9BT56 116 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 PRSS2P07478 247 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 HERV-K104P63124 156 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 MED13LQ71F56 2210 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 IGLV1-40P01703 118 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 CD28P10747 220 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TMEM101Q96IK0 257 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 CDSNQ15517 529 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 CCL21O00585 134 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 CLEC2BQ92478 149 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 DUX3Q96PT4 197 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 LINC01587Q99440 93 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-11P01762 117 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 K7ENP7 123 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 NDUFA1O15239 70 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 CFHR3Q02985 330 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 ATP5G1P05496 136 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 PF4V1P10720 104 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 FLNCQ14315 2725 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 FBN3Q75N90 2809 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 A0A1W2PPR1 153 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 A6NDX4 124 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZSV7 163 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 LINC00643Q86TS7 51 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 LRRK2Q5S007 2527 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 K7EQG2 157 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 COX7A2LO14548 114 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 TIRAPP58753 221 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 TRACP01848 142 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 EDN2P20800 178 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 CXCL5P42830 114 aa8.21□□□□□ -1.09
GINS3-202ENST00000328514 COPS9Q8WXC6 57 aa8.21□□□□□ -1.09
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GINS3-202ENST00000328514 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.21□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.2□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 A8MZ25 164 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 UQCRQO14949 82 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 DAND5Q8N907 189 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 PEMTQ9UBM1 199 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 BLCAPP62952 87 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 C5orf38Q86SI9 138 aa8.19□□□□□ -1.1
GINS3-202ENST00000328514 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.19□□□□□ -1.1
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