RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 FBN2P35556 2912 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 H3BUA1 57 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 DEFB131AP59861 70 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 A0A0J9YXY3 114 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 CHD6Q8TD26 2715 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 K7EQG2 157 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 PSMB8P28062 276 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 RNF183Q96D59 192 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 K7EMT4 169 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 GATA3P23771 443 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 SLURP1P55000 103 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 RHOHQ15669 191 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 Q6ZSN1 163 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRH-201ENST00000263434 CLEC2BQ92478 149 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 TRIAP1O43715 76 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 CFHR3Q02985 330 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 LINC01620Q4KN68 170 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 NF1P21359 2839 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 B4DSR2 109 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 PIEZO1Q92508 2521 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 TEX29Q8N6K0 151 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 CRLF1O75462 422 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 ATXN8Q156A1 80 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 LINC01587Q99440 93 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 M0R2P5 195 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.23□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 C2orf82Q6UX34 121 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 SNCGO76070 127 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV3-53P01767 116 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRH-201ENST00000263434 A0A0B4J2C4 111 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2E2Q96LR5 201 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 NDUFA7O95182 113 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 FAM104AQ969W3 186 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 BRI3O95415 125 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 XCL2Q9UBD3 114 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 TTC32Q5I0X7 151 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM262E9PQX1 116 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE2BQ13066 116 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE2EQ4V326 116 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 LITAFQ99732 161 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 B5MCH6 92 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 H3BMM0 161 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2WQ96B02 151 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 ODF3Q96PU9 254 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1W2PRX2 142 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 COX6CP09669 75 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRH-201ENST00000263434 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms