RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 TMEM89A2RUT3 159 aa8.76□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.76□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 ZNF524Q96C55 264 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 NDUFC1O43677 76 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 RNF138Q8WVD3 245 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 TCL1BO95988 128 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.75□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 PATE2Q6UY27 113 aa8.74□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 C20orf197Q8N268 126 aa8.74□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.74□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 FAM236CP0DP71 79 aa8.74□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.73□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 PRAC2D3DTV9 90 aa8.73□□□□□ -1.01
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THBS1-201ENST00000260356 NFE4Q86UQ8 179 aa8.72□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.72□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.72□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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THBS1-201ENST00000260356 PIP4P1Q86T03 277 aa8.71□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 PTH2Q96A98 100 aa8.71□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 H7C423 109 aa8.71□□□□□ -1.01
THBS1-201ENST00000260356 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.71□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 DEFB4AO15263 64 aa8.71□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 A0A0J9YX75 114 aa8.71□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.71□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 SPRNQ5BIV9 151 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 A0A0J9YXY3 114 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.7□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 REG3AQ06141 175 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.69□□□□□ -1.02
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THBS1-201ENST00000260356 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 A0A0U1RQV1 116 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 ENHOQ6UWT2 76 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 SIRPDQ9H106 197 aa8.67□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 A0A087WZ39 114 aa8.67□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 A6NED7 52 aa8.67□□□□□ -1.02
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THBS1-201ENST00000260356 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.67□□□□□ -1.02
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THBS1-201ENST00000260356 IGLV1-47P01700 117 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 Q6ZSR3 168 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 LYRM9A8MSI8 78 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 E7EUB6 86 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 SPRY4Q9C004 299 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 IMUPQ9GZP8 106 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 LYPD6Q86Y78 171 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 MT-ATP8P03928 68 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS1-201ENST00000260356 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.65□□□□□ -1.03
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THBS1-201ENST00000260356 FAM231AP0DMU4 169 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 FAM231CP0DMU5 169 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 MLST8Q9BVC4 326 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 A0A1B0GXF2 115 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 A0A096LNI7 61 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 DEFB1P60022 68 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.64□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 IGLV2-14P01704 120 aa8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 CCKP06307 115 aa8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 JMJD1CQ15652 2540 aa8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 PIEZO1Q92508 2521 aa8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
THBS1-201ENST00000260356 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.62□□□□□ -1.03
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