RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 TSPAN13O95857 204 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 F8W1H4 67 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 Q6YL49 198 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 SLURP1P55000 103 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 PROK1P58294 105 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 SYT8Q8NBV8 401 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01549A6NIU2 74 aa9.79□□□□□ -0.84
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C9orf170-201ENST00000623052 NFE4Q86UQ8 179 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 Q9UF83 564 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-30P01768 117 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 SCGB2A2Q13296 93 aa9.79□□□□□ -0.84
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C9orf170-201ENST00000623052 J3QLI3 93 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 PRB1P04280 392 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 RHOHQ15669 191 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 ELANEP08246 267 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 ETDBQ3ZM63 59 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 INSL3P51460 131 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 SFTA2Q6UW10 78 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.77□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM223A0PJW6 202 aa9.77□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP10-9P60411 292 aa9.77□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 HERVK_113P61574 105 aa9.77□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
C9orf170-201ENST00000623052 USP24Q9UPU5 2620 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 A8MTW9 85 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 J3QQQ9 107 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2D3P61077 147 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2D2P62837 147 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 CFC1BP0CG36 223 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 CFC1P0CG37 223 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE13Q4V321 117 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZSN1 163 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 DUX3Q96PT4 197 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 I3L3M4 83 aa9.76□□□□□ -0.85
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C9orf170-201ENST00000623052 DEFB131AP59861 70 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 ACACBO00763 2458 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0J9YXV3 536 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 H3BMM0 161 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 HTN1P15515 57 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.75□□□□□ -0.85
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C9orf170-201ENST00000623052 A6NJY4 79 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 RHODO00212 210 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.73□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 PTPN13Q12923 2485 aa9.73□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 LEPROTO15243 131 aa9.73□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.73□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 Q8N2B8 174 aa9.73□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.73□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.71□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 CD28P10747 220 aa9.71□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
C9orf170-201ENST00000623052 TCL1BO95988 128 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 Q5PR19 223 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 CREBBPQ92793 2442 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 PSMB2P49721 201 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM238C9JI98 176 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA25Q9BR10 227 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.69□□□□□ -0.86
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