RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	XG	P55808	180 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ILF3-223	ENST00000593061	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ILF3-223	ENST00000593061	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ILF3-223	ENST00000593061	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ILF3-223	ENST00000593061	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	XKRY2	A2RUG3	117 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061		Q8N814	137 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	TM2D2	Q9BX73	214 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	SST	P61278	116 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF56	Q15929	161 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	EPM2A	B3EWF7	344 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	ADIRF	Q15847	76 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	NIT1	Q86X76	327 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	ISOC2	Q96AB3	205 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	OSTC	Q9NRP0	149 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	LECT2	O14960	151 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	SNAI2	O43623	268 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	OR5AL1	P0C617	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	GZMB	P10144	247 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	RAB4B	P61018	213 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	UBE2D3	P61077	147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	UBE2D2	P62837	147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	HAMP	P81172	84 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	WFDC2	Q14508	124 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM218	A2RU14	115 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	IGLC6	P0CF74	106 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	CT83	Q5H943	113 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ILF3-223	ENST00000593061		A0A087WX48	190 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061		A8MWL6	223 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	KLK12	Q9UKR0	248 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061		F2Z2F3	143 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061		F5H697	171 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	TPPP3	Q9BW30	176 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	SMIM17	P0DL12	118 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061		Q5VSD8	79 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	FRZB	Q92765	325 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	UBE2W	Q96B02	151 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	RMI2	Q96E14	147 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM262	E9PQX1	116 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061		F8W036	122 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	BAALC	Q8WXS3	180 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	AP1S3	Q96PC3	154 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061		V9GYV3	84 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	ADCYAP1	P18509	176 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	CTRL	P40313	264 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	CACNG7	P62955	275 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	TSKU	Q8WUA8	353 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	SEC11C	Q9BY50	192 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	COX11	Q9Y6N1	276 aa		12.73	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	FAM231B	A6NCW3	169 aa		12.72	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	ELOB	Q15370	118 aa		12.72	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	WDR73	Q6P4I2	378 aa		12.72	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	GTSF1	Q8WW33	167 aa		12.72	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		12.72	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	MGP	P08493	103 aa		12.71	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		12.71	□□□□□ -0.37
ILF3-223	ENST00000593061	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		12.7	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	CNFN	Q9BYD5	112 aa		12.7	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		12.7	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	PPP1R2P9	O14990	202 aa		12.69	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		12.69	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	MPV17L2	Q567V2	206 aa		12.69	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		12.69	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		12.69	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	HIGD1C	A8MV81	97 aa		12.68	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	CRP	P02741	224 aa		12.68	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	MT-ND4L	P03901	98 aa		12.68	□□□□□ -0.38
ILF3-223	ENST00000593061	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38

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