RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 SNAI2O43623 268 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 AZU1P20160 251 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF415Q09FC8 603 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 RIGQ13278 110 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 UPK3BQ9BT76 320 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 CDIP1Q9H305 208 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 GCSHP23434 173 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 CACNG7P62955 275 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 WDR73Q6P4I2 378 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 C9orf85Q96MD7 179 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1B0GW15 77 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 SSTP61278 116 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 HBBP68871 147 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 TWIST1Q15672 202 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 C16orf74Q96GX8 76 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 SPXQ9BT56 116 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 CNFNQ9BYD5 112 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1B0GXF2 115 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 SNURFLB1AK76 121 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 M0R381 172 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 S100A8P05109 93 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 RAB5AP20339 215 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 NTF3P20783 257 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 CAMPP49913 170 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 RAB4BP61018 213 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 COX19Q49B96 90 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 RASL11AQ6T310 242 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 ZFP82Q8N141 532 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-210ENST00000580713 A0A087WTM6 91 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 NXPH4O95158 308 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 LCE3BQ5TA77 95 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 M0R2P5 195 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 SIVA1O15304 175 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 HLA-DQA1P01909 254 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 MT-ND6P03923 174 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 TRGC1P0CF51 173 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 NFE4Q86UQ8 179 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF876PQ49A33 203 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 GATD1Q8NB37 220 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 PTH2Q96A98 100 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 AP1S3Q96PC3 154 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE12BA1L429 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE7O76087 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE12FP0CL80 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE12GP0CL81 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE12IP0CL82 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 HOXA5P20719 270 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 APCSP02743 223 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM17P0DL12 118 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 EVI2AP22794 236 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 RASL10AQ92737 203 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 JPT2Q9H910 190 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 A8MWV9 139 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 H3BNG1 76 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 PAX4O43316 350 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 TRGC2P03986 189 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 SLAQ13239 276 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZTI0 123 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-210ENST00000580713 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.28□□□□□ -1.24
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