RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00479Q96M42 142 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 GABARAPL3Q9BY60 117 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 FXYD6Q9H0Q3 95 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 HERC2O95714 4834 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 NXPH4O95158 308 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGKCP01834 107 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 BGLAPP02818 100 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SMIM13P0DJ93 91 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 VDAC1P21796 283 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP5-9P26371 169 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ERVK-16P61578 105 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2BP63146 152 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CXCL6P80162 114 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA0087Q14695 138 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 MGST2Q99735 147 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1B0GWA3 101 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ATOX1O00244 68 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TCL1BO95988 128 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 HBDP02042 147 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SYNJ2BPP57105 145 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TIFABQ6ZNK6 161 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 OR5AS1Q8N127 324 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 DSCR8Q96T75 97 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF286AQ9HBT8 521 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-13P01766 116 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TFF1P04155 84 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 HLA-DPB1P04440 258 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGLL1P15814 213 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 DAPP51397 102 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 DYNLT3P51808 116 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF138P52744 262 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 MPV17LQ2QL34 196 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 Q8N976 141 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM243Q9BU79 118 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 PRO0461Q9UI25 63 aa4.03□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CD7P09564 240 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CD28P10747 220 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF32P17041 273 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CCL20P78556 96 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TSKUQ8WUA8 353 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 GTSF1Q8WW33 167 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1-5P01602 117 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV1-69P01742 117 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-7P01780 117 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 AQP1P29972 269 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 TWIST1Q15672 202 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 LY6EQ16553 131 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF876PQ49A33 203 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 MIC13Q5XKP0 118 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 GPHB5Q86YW7 130 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-209ENST00000561136 CEND1Q8N111 149 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms