RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560207.1

RABGGTA-215, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-215ENST00000560207 LINC00694P0DN24 101 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 ADCYAP1P18509 176 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 S100PP25815 95 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 PKIAP61925 76 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 HBBP68871 147 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 Q6ZSN1 163 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 MRAP2Q96G30 205 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 GAGE12JA6NER3 117 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 SIVA1O15304 175 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 UBE2D3P61077 147 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGGTA-215ENST00000560207 GAGE5Q13069 117 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 GAGE13Q4V321 117 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 LELP1Q5T871 98 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 Q9H8V8 135 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 COX19Q49B96 90 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.3□□□□□ -1.08
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RABGGTA-215ENST00000560207 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.3□□□□□ -1.08
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RABGGTA-215ENST00000560207 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A1B0GXF2 115 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 APOC3P02656 99 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 RAB4AP20338 218 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 CAMPP49913 170 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGGTA-215ENST00000560207 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTA-215ENST00000560207 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTA-215ENST00000560207 PHOX2AO14813 284 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 ELOBQ15370 118 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 H7C423 109 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTA-215ENST00000560207 I3L3M4 83 aa8.24□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 LAGE3Q14657 143 aa8.24□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 ORMDL3Q8N138 153 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTA-215ENST00000560207 Q9UF83 564 aa8.24□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.23□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 PMCHP20382 165 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTA-215ENST00000560207 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
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RABGGTA-215ENST00000560207 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTA-215ENST00000560207 K7EMI3 77 aa8.21□□□□□ -1.1
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RABGGTA-215ENST00000560207 C6orf223Q8N319 242 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTA-215ENST00000560207 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGGTA-215ENST00000560207 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTA-215ENST00000560207 TMEM243Q9BU79 118 aa8.21□□□□□ -1.1
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RABGGTA-215ENST00000560207 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTA-215ENST00000560207 A0A1B0GUV1 79 aa8.2□□□□□ -1.1
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