RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 B9D2Q9BPU9 175 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 MUC4Q99102 2169 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ODF3BA8MYP8 253 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 DKK2Q9UBU2 259 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0J9YX75 114 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf86A6NJI1 115 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB135Q30KP9 77 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV3-30P01768 117 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV3-33P01772 117 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGLL5B9A064 214 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 BAALCQ8WXS3 180 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 PRR31Q5SQ13 230 aa4.9□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 NFE4Q86UQ8 179 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 DIRC1Q969H9 104 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 MIFP14174 115 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 MDFICQ9P1T7 246 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 LMO4P61968 165 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 HIGD1BQ9P298 99 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM258P61165 79 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA25Q9BR10 227 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 PRO3102Q9H379 93 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 K7EP13 123 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV2-14P01704 120 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 SPAG11BQ08648 103 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 LINC01620Q4KN68 170 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 NRGNQ92686 78 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 E9PLD3 99 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 A4D1N5 150 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 LINC01548A6NM66 108 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 RNF183Q96D59 192 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 WIPF3A6NGB9 483 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 CRYBA4P53673 196 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0B4J2C4 111 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 MP68P56378 58 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 PATE2Q6UY27 113 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 KLK12Q9UKR0 248 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 LYPD6Q86Y78 171 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 NREPQ16612 68 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 EP400Q96L91 3159 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 H3BMG7 143 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 EBI3Q14213 229 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 GTSF1Q8WW33 167 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 CRYGDP07320 174 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB125Q8N687 156 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 ACACBO00763 2458 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 K7EQG2 157 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 NPSP0C0P6 89 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 E7EUB6 86 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 K7ERJ3 54 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 ATOX1O00244 68 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV12-3P01733 135 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 LY6LH3BQJ8 138 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC140Q96MF4 163 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1B0GX51 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 CRYGBP07316 175 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 PRAC2D3DTV9 90 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 COX7BP24311 80 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 PCP2Q8IVA1 136 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 C7orf33Q8WU49 177 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 INAFM1C9JVW0 142 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 PSMB8P28062 276 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 SEC61GP60059 68 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.84□□□□□ -1.63
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