RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 BORCS7Q96B45 105 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 DERL1Q9BUN8 251 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 C16orf95Q9H693 158 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-214ENST00000530727 CRYBA1P05813 215 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-214ENST00000530727 HIST1H2BAQ96A08 127 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRC-214ENST00000530727 S100A7P31151 101 aa2.87□□□□□ -1.95
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PTPRC-214ENST00000530727 RNF212Q495C1 297 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-214ENST00000530727 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-214ENST00000530727 ORAOV1Q8WV07 137 aa2.87□□□□□ -1.95
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