RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 TSKUQ8WUA8 353 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 GTSF1Q8WW33 167 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF479Q96JC4 524 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 CNFNQ9BYD5 112 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 V9GYV3 84 aa9.57□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 F8W036 122 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 M0R381 172 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 CRYGDP07320 174 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 CTRLP40313 264 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.56□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 ADCYAP1P18509 176 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP1R2P9O14990 202 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 TPPP3Q9BW30 176 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 JPT2Q9H910 190 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 K7EQD1 137 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 RHODO00212 210 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 MT-ND4LP03901 98 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 NTF3P20783 257 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 Q8N814 137 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 HIGD1CA8MV81 97 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 GYPEP15421 78 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.52□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 TWIST1Q15672 202 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 NUP35Q8NFH5 326 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.51□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A087WWL8 130 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1B0GUT8 65 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 TRGC1P0CF51 173 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB4BP61018 213 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 SSTP61278 116 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 NDUFA5Q16718 116 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 BORCS7Q96B45 105 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 AP1S3Q96PC3 154 aa9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM17P0DL12 118 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.49□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 RIGQ13278 110 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 RHOHQ15669 191 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 IMMP2LQ96T52 175 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 Q9HAA7 133 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.48□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 Q6ZSA8 131 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.47□□□□□ -0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1B0GW15 77 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 OXTP01178 125 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.46□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A087WWC5 75 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 F5H697 171 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 TIRAPP58753 221 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 RHEBQ15382 184 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 SVBPQ8N300 66 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.45□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 APOC3P02656 99 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF56Q15929 161 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 TM2D2Q9BX73 214 aa9.44□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.43□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 H7C1H1 209 aa9.43□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 M0QY20 66 aa9.43□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 SNAPINO95295 136 aa9.43□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 S100A8P05109 93 aa9.43□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.43□□□□□ -0.9
UBASH3B-202ENST00000525711 Q9UF83 564 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms