RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 I3L3M4 83 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 M0R2P5 195 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 ATRXP46100 2492 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0J9YXV3 536 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM262E9PQX1 116 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 C19orf84I3L1E1 186 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 C9JAW5 83 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 LINC01600Q96MT4 127 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF580Q9UK33 172 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0J9YXY3 114 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 K7EQG2 157 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRK-217ENST00000524534 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 FAM104AQ969W3 186 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRK-217ENST00000524534 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 RNF152Q8N8N0 203 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 LITAFQ99732 161 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 H7C2G1 150 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 ELANEP08246 267 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 ATXN8Q156A1 80 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRK-217ENST00000524534 IGF2RP11717 2491 aa8.46□□□□□ -1.05
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PTPRK-217ENST00000524534 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 LINC01620Q4KN68 170 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 CITED1Q99966 193 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 VPS13CQ709C8 3753 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRK-217ENST00000524534 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 SPXQ9BT56 116 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 Q1RN00 199 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 RNF183Q96D59 192 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRK-217ENST00000524534 CD28P10747 220 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRK-217ENST00000524534 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRK-217ENST00000524534 SPANXCQ9NY87 97 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM89A2RUT3 159 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRK-217ENST00000524534 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRK-217ENST00000524534 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 Q5PR19 223 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 LY6DQ14210 128 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 CCL19Q99731 98 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRK-217ENST00000524534 PROK1P58294 105 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRK-217ENST00000524534 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 SYNJ2BPP57105 145 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 PRSS2P07478 247 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 MIAQ16674 131 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-217ENST00000524534 GATA3P23771 443 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV4-59P01825 116 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 ATP5J2P56134 94 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 H3BMM0 161 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 H7C423 109 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 CRLF1O75462 422 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-217ENST00000524534 SNCGO76070 127 aa8.39□□□□□ -1.07
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