RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523364.1

HOXA-AS2-209, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXA-AS2, Length 989 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UBE2G2P60604 165 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UBE2G1P62253 170 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MIAQ16674 131 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ENHOQ6UWT2 76 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MED28Q9H204 178 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRR34Q9NV39 138 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 VAX2Q9UIW0 290 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 Q5BKY6 102 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 USP17L23D6RBM5 183 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMEM262E9PQX1 116 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SNAI2O43623 268 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 OR5AL1P0C617 328 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MPV17L2Q567V2 206 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 STOML3Q8TAV4 291 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRSS1P07477 247 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AKR1C3P42330 323 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MLST8Q9BVC4 326 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 A0A0U1RQV1 116 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF56Q15929 161 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 HLA-DQA1P01909 254 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IQCJQ1A5X6 159 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CST9LP1Q5W188 147 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 A0A0D9SG52 128 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 P01737 135 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GZMBP10144 247 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RBX1P62877 108 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RNF185Q96GF1 192 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 A0A1B0GUV1 79 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UMAD1C9J7I0 102 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 G3V3Q6 166 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PAGE4O60829 102 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMIM17P0DL12 118 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 BAGE2Q86Y30 109 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LINC01600Q96MT4 127 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AP1S3Q96PC3 154 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DERL1Q9BUN8 251 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 F5H697 171 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 H3BS24 57 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 H7C1H1 209 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PFDN1O60925 122 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 BATF3Q9NR55 127 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXA-AS2-209ENST00000523364 M0QY20 66 aa7.02□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 REG3AQ06141 175 aa7.02□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF345Q14585 488 aa7.02□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ARPC5O15511 151 aa7.01□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GAGE6Q13070 117 aa7.01□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.01□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.01□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PANO1I0J062 215 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGLC6P0CF74 106 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CACNG7P62955 275 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMUB2Q71RG4 321 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KCNRGQ8N5I3 272 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C20orf203Q8NBC4 194 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C11orf52Q96A22 123 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMIM12Q96EX1 92 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AP5S1Q9NUS5 200 aa7□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 hDV102S1A0JD36 115 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 F2Z2F3 143 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMEM243Q9BU79 118 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms