RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 EDDM3BP56851 147 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 PYDC1Q8WXC3 89 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 BATF3Q9NR55 127 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYH6P13533 1939 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSPG2P98160 4391 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 C10orf142B7Z368 130 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 M0R129 80 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 LPAP08519 4548 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEP152O94986 1710 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 DR1Q01658 176 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q5VV11 94 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q6ZUT4 128 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPRMQ9NS64 109 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF815PA8K554 130 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC00694P0DN24 101 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFITM1P13164 125 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRP2P98164 4655 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 PXDNQ92626 1479 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 VWFP04275 2813 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARPC5O15511 151 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFNA17P01571 189 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 CKS1BP61024 79 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBE2G1P62253 170 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSKIPQ9P0R6 139 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIN1P1O15428 100 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCIMPQ6UWF3 145 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF609O15014 1411 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDM2Q13029 1718 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 J3QR89 54 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPFFO15130 113 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL5P05113 134 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 CBLN1P23435 193 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZANQ9Y493 2812 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A0D9SFI3 127 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 A6NIN4 97 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 M0R2Z0 102 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 WFDC2Q14508 124 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALX1Q15699 326 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNXBP22105 4242 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 M0R3E3 92 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCL18P55774 89 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCL8P80075 99 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 LAMC1P11047 1609 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 WNK3Q9BYP7 1800 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 K7ERU9 68 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFB6O95139 128 aa-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms