RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf194Q5T5A4 169 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 GDPD1Q8N9F7 314 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF555Q8NEP9 628 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 DCANP1Q8TF63 244 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 ACY3Q96HD9 319 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 C14orf144Q96I85 54 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 GINS4Q9BRT9 223 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM126AQ9H061 195 aa2.75□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1B0GVG6 124 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 IGLC7A0M8Q6 106 aa2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 NAPSAO96009 420 aa2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 HTN1P15515 57 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 ORM2P19652 201 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 S100A2P29034 98 aa2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 PSMB3P49720 205 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 PSG9Q00887 426 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 CANT1Q8WVQ1 401 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A46Q96AG3 418 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 LINC00052Q96N35 136 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 SLC35B3Q9H1N7 401 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1B0GX51 115 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 H3BNG1 76 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 K7EIM0 57 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TRAPPC2P0DI81 140 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TRAPPC2BP0DI82 140 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 AKR1D1P51857 326 aa2.73□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 CHCHD7Q9BUK0 85 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 AK3Q9UIJ7 227 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 A0A096LPF7 62 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 J3KT08 172 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 ISLRO14498 428 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 IGKV1-39P01597 117 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 IGKV1D-39P04432 117 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 UBBP0CG47 229 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 WT1-ASQ06250 92 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 ACBD7Q8N6N7 88 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 C15orf56Q8N910 161 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 Q8N9L7 120 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 OR5A1Q8NGJ0 315 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 NIT2Q9NQR4 276 aa2.72□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 BET1LQ9NYM9 111 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-217ENST00000509355 CRYBB3P26998 211 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 S100A11P31949 105 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 DEFB1P60022 68 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 HERVK_113P63121 156 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 BTN1A1Q13410 526 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 TDRG1Q3Y452 100 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 C12orf73Q69YU5 71 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-217ENST00000509355 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.71□□□□□ -1.98
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