RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 KRTAP10-3P60369 221 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 Q8N1Y9 231 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 IGLV1-40P01703 118 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 EDDM3AQ14507 147 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 RNF185Q96GF1 192 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 JPT2Q9H910 190 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 H3BUA1 57 aa5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 Q6ZSV7 163 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 Q8N8P6 123 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 IGHV4-59P01825 116 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 TIMM23O14925 209 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.78□□□□□ -1.48
USP4-211ENST00000485450 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PRX2 142 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 F8VRH5 84 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 H7C1H1 209 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 IGKV1-16P04430 117 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 CRYGAP11844 174 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 UQCRQO14949 82 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 IGHV3-48P01763 117 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 WT1-ASQ06250 92 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 GAS8-AS1O95177 125 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 LEAP2Q969E1 77 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 SPANXCQ9NY87 97 aa5.77□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 AKAP6Q13023 2319 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 E7EUB6 86 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 CFC1BP0CG36 223 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 CFC1P0CG37 223 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 CNTFRP26992 372 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 HES1Q14469 280 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 LINC01006Q8NI28 216 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 CGB1A6NKQ9 187 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 LGALS9O00182 355 aa5.76□□□□□ -1.49
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USP4-211ENST00000485450 DLX1P56177 255 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 C8orf49Q96NF6 230 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.76□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 ZNF815PA8K554 130 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 SH2D1AO60880 128 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 DSCR8Q96T75 97 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 CNFNQ9BYD5 112 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 ELANEP08246 267 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 LAGE3Q14657 143 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 UPK3BQ9BT76 320 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 EPM2AB3EWF7 344 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 P0DMU3 169 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 FAM231AP0DMU4 169 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 FAM231CP0DMU5 169 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 PSMB8P28062 276 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 MDFIQ99750 246 aa5.75□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 H3BUX3 64 aa5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 NBR2O15453 112 aa5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 PRR25Q96S07 402 aa5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 IMUPQ9GZP8 106 aa5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 ZNF575Q86XF7 245 aa5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.74□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 A0A0J9YY99 117 aa5.73□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 TEX22C9J3V5 150 aa5.73□□□□□ -1.49
USP4-211ENST00000485450 H3BMM0 161 aa5.73□□□□□ -1.49
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