RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 SORL1Q92673 2214 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 GAGE12JA6NER3 117 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 GAGE7O76087 117 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 GAGE12FP0CL80 117 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 GAGE12GP0CL81 117 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 GAGE12IP0CL82 117 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2E1P51965 193 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 GAGE4Q13068 117 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZSV7 163 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01620Q4KN68 170 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 ODF3Q96PU9 254 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS13CQ709C8 3753 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNA1AO00555 2505 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM223A0PJW6 202 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 IFITM1P13164 125 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIAP1O43715 76 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 UCNP55089 124 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PPR1 153 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS2P07478 247 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 MDFICQ9P1T7 246 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 LEPROTO15243 131 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 ATXN8Q156A1 80 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TTC32Q5I0X7 151 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 NPFFO15130 113 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 LY6EQ16553 131 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM110AQ9BQ89 295 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 A8MZ25 164 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFA4O00483 81 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0J9YXY3 114 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM223BA6NKX1 122 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 LY6DQ14210 128 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0J9YX75 114 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 KLLNB2CW77 178 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 CLEC2BQ92478 149 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 27.8
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 M0QY20 66 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 M0R2P5 195 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV1-69P01742 117 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 MOB4Q9Y3A3 225 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BMM0 161 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 LGALS9O00182 355 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 C2orf82Q6UX34 121 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 C3orf56Q8N813 242 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2WQ96B02 151 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 CREBBPQ92793 2442 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 KLRB1Q12918 225 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX3Q96PT4 197 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 SHISA2Q6UWI4 295 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 SMIM20Q8N5G0 67 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 HTN1P15515 57 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 DAND5Q8N907 189 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 LITAFQ99732 161 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 TIMM21Q9BVV7 248 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 SPANXA1Q9NS26 97 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 H7C423 109 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 HERV-K104P63124 156 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 ACACBO00763 2458 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 CD28P10747 220 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 LMO4P61968 165 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 PROK1P58294 105 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 BLCAPP62952 87 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.9 ms