RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	UBE2D3	P61077	147 aa		12.06	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	UBE2D2	P62837	147 aa		12.06	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		12.06	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	TSKU	Q8WUA8	353 aa		12.06	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	TNP2	Q05952	138 aa		12.05	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	CLLU1	Q5K131	121 aa		12.05	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		12.05	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	CNFN	Q9BYD5	112 aa		12.05	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		12.05	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GVY2	172 aa		12.04	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	HIGD1C	A8MV81	97 aa		12.04	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902		K7EP13	123 aa		12.04	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		12.04	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		12.04	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902		V9GYV3	84 aa		12.04	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902		M0QY20	66 aa		12.03	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	IFITM2	Q01629	132 aa		12.03	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		12.03	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		12.03	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	PKHD1	P08F94	4074 aa		12.03	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		12.02	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
USP19-210	ENST00000465902	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		12.02	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GUT8	65 aa		12.02	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	RASL11A	Q6T310	242 aa		12.02	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	NFE4	Q86UQ8	179 aa		12.02	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	FAM231B	A6NCW3	169 aa		12.01	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		12.01	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		12	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902		Q8N3U1	123 aa		12	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902		Q9HAA7	133 aa		12	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	NUP35	Q8NFH5	326 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	PKD1	P98161	4303 aa		11.99	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WX48	190 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	RIG	Q13278	110 aa		11.98	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	NIT1	Q86X76	327 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.97	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	PSCA	O43653	123 aa		11.96	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
USP19-210	ENST00000465902	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.95	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.94	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	EREG	O14944	169 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	CAMP	P49913	170 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	FRZB	Q92765	325 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.93	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	LAGE3	Q14657	143 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	ELOB	Q15370	118 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	UQCC3	Q6UW78	93 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	MT-ND4L	P03901	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	PKIA	P61925	76 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	GAGE6	Q13070	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	COTL1	Q14019	142 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902		F8W036	122 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	RAB4A	P20338	218 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	MPV17L2	Q567V2	206 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP19-210	ENST00000465902	TMEM218	A2RU14	115 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	AMT	P48728	403 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GW15	77 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	UBE2L6	O14933	153 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	PMCH	P20382	165 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902		Q8N976	141 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WTM6	91 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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