RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	NIT2	Q9NQR4	276 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	SMKR1	H3BMG3	65 aa		5.78	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	CKS2	P33552	79 aa		5.78	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		5.78	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		5.78	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	ATRAID	Q6UW56	229 aa		5.78	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		5.78	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	RNF185	Q96GF1	192 aa		5.78	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		5.78	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GXF2	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	PMCH	P20382	165 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	UBE2D3	P61077	147 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	UBE2D2	P62837	147 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	MRAP2	Q96G30	205 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710		Q9H8V8	135 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	ST20	Q9HBF5	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	LCE6A	A0A183	80 aa		5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	GAS8-AS1	O95177	125 aa		5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	NCR2	O95944	276 aa		5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	FRZB	Q92765	325 aa		5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710		D6R8Y8	96 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TMEM262	E9PQX1	116 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710		M0R2N4	97 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	PPP1R17	O96001	155 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	APCS	P02743	223 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	ELOB	Q15370	118 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	COX19	Q49B96	90 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	LELP1	Q5T871	98 aa		5.75	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	VCY	O14598	125 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	SIVA1	O15304	175 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	PPBP	P02775	128 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	COTL1	Q14019	142 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	ORMDL3	Q8N138	153 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	PRELID3A	Q96N28	172 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.74	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710		I3L3M4	83 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	IGHV3-30	P01768	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	IGHV3-33	P01772	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	LINC00694	P0DN24	101 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TIRAP	P58753	221 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	UBE2L6	O14933	153 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	NPY	P01303	97 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	S100A1	P23297	94 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	FCER1G	P30273	86 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	AMT	P48728	403 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	NRAC	Q8N912	160 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	C20orf78	Q9BR46	151 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		5.72	□□□□□ -1.49
IL6-208	ENST00000464710		A0A087WX48	190 aa		5.71	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	SCO1	O75880	301 aa		5.71	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	MT-ND6	P03923	174 aa		5.71	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	GAGE6	Q13070	117 aa		5.71	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	KIR2DL4	Q99706	377 aa		5.71	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5.71	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		5.71	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		5.7	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	PHOX2A	O14813	284 aa		5.7	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	ATP6V1G1	O75348	118 aa		5.7	□□□□□ -1.5
IL6-208	ENST00000464710	RAB5A	P20339	215 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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