RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 MED13LQ71F56 2210 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 M0QY20 66 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF688P0C7X2 276 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZQT7 251 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 NFE4Q86UQ8 179 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SMR3AQ99954 134 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF702PQ9H963 129 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.32□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 RHODO00212 210 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 CRYGDP07320 174 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SRD5A1P18405 259 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 FXYD2P54710 66 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SYNJ2BPP57105 145 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 C12orf74Q32Q52 190 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF876PQ49A33 203 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 Q8N1Y9 231 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 MDFICQ9P1T7 246 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 VPS13CQ709C8 3753 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 IGLL5B9A064 214 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF415Q09FC8 603 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF56Q15929 161 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 AMTNQ6UX39 209 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 RAB37Q96AX2 223 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF479Q96JC4 524 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF815PA8K554 130 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 INAFM1C9JVW0 142 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 G3V4G9 280 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 M0R2P5 195 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 RRN3P1Q2M238 152 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 LCE1DQ5T752 114 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 RAX2Q96IS3 184 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 DUX5Q96PT3 197 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 VPS25Q9BRG1 176 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 H3BMM0 161 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 LEPROTO15243 131 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 CIDEAO60543 219 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 DEFB1P60022 68 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 VCX2Q9H322 139 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WWL8 130 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 CRLF1O75462 422 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 TSHBP01222 138 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 PCP4P48539 62 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 J3QQQ9 107 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 UBE2D1P51668 147 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 TCTAP57738 103 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 DEFB131AP59861 70 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 GAGE13Q4V321 117 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 MUC4Q99102 2169 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 HIVEP2P31629 2446 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 A0A0J9YY99 117 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 TMEM223A0PJW6 202 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 INSP01308 110 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 RNF151Q2KHN1 245 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTB-208ENST00000464611 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.25□□□□□ -1.41
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