RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462626.1

EML3-208, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 2

Gene EML3, Length 463 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-208	ENST00000462626	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	VAX2	Q9UIW0	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626		F5H697	171 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	PKIA	P61925	76 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	C14orf177	Q52M58	125 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	C11orf52	Q96A22	123 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626		J3QL48	77 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	CRP	P02741	224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EML3-208	ENST00000462626	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	CCL20	P78556	96 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	AP1S3	Q96PC3	154 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	DERL1	Q9BUN8	251 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	SMIM17	P0DL12	118 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	SST	P61278	116 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	MIA	Q16674	131 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	PRR34	Q9NV39	138 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	GNG13	Q9P2W3	67 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	CENPW	Q5EE01	88 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	USP17L23	D6RBM5	183 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626		M0QY20	66 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	RBX1	P62877	108 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	GZMB	P10144	247 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	RAB5C	P51148	216 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EML3-208	ENST00000462626	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	SMIM12	Q96EX1	92 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	PRSS1	P07477	247 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	GAGE6	Q13070	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626		H7C1H1	209 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	CACNG7	P62955	275 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	RAB19	A4D1S5	217 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	MGP	P08493	103 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	GNG4	P50150	75 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626		F2Z2F3	143 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	PDE6D	O43924	150 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	SULT1A2	P50226	295 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-208	ENST00000462626	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626		P01737	135 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	REG3A	Q06141	175 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626		A0A1B0GUV1	79 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	IFNA1	P01562	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	TMEM243	Q9BU79	118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	MED9	Q9NWA0	146 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	BCL2	P10415	239 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	OXT	P01178	125 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	NTF3	P20783	257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	CTRL	P40313	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EML3-208	ENST00000462626	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25

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